IBMのJDK5.0でNetbeansが動かないことは報告されていた

netbeans.orgに既に報告されていました。

http://www.netbeans.org/issues/show_bug.cgi?id=66563

やはり同じところで躓いた人がいたようですね。
Linuxでも同じ理由で落ちるようです。

http://www.netbeans.org/issues/show_bug.cgi?id=72815

こちらに移ってますね。
どうやらXalanをIBMTigerxml.jarから消すと動くようですが、
それをやると後に新しいプロジェクトを作成する場合に例外で落ちるようです。

残念ながらまだ直っておらずVolunteer募集となっております。